Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR11A4FU01 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTMR11A4FU01 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms