Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms