Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF6Q9Y4K3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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