Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RCE1Q9Y256 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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