Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms