Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms