Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF346Q9UL40 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms