Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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