Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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