Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms