Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD5Q9P267 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms