Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNIH4Q9P003 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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