Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms