Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms