Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C11orf49Q9H6J7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms