Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLMPQ9H6B4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms