Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms