Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARD11Q9BXL7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms