Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms