Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP8Q9BV40 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms