Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms