Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBL7Q96S82 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms