Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms