Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRC1Q96M27 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms