Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms