Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms