Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms