Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00526Q96FQ7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms