Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 489.4 ms