Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC9Q92623 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms