Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms