Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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