Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms