Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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