Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms