Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms