Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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