Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT80Q6KB66 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms