Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms