Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms