Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATP6V1FQ16864 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms