Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPRNQ16849 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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