Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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VPS72Q15906 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS72Q15906 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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