Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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