Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms