Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms