Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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