Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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