Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGEF6Q15052 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms