Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLCA4Q14CN2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLCA4Q14CN2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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